Accompagné de la famille Brown, Paddington part en voyage au Pérou pour rendre visite à Lucy, sa tante bien-aimée, qui réside dans une maison de retraite pour ours. Mais Tante Lucy a mystérieusement disparu. Pour Paddington et la famille Brown, c’est le début d’une expédition rocambolesque qui les mènera de la jungle amazonienne jusqu’aux sommets des montagnes péruviennes.