Un beau jour, Nagi reçoit une invitation pour participer à un projet mystérieux nommé «Blue Lock», où il retrouvera les plus grands attaquants du football lycéen japonais. Le rêve qu'il partage avec Reo de devenir les meilleurs joueurs motivera le prodige à explorer de nouveaux horizons dans le monde inconnu qui l'attend. Un génie ne se dévoile comme tel que quand on découvre son potentiel… et c'est au tour de Nagi d'enflammer le monde du football avec son incroyable talent et sa personnalité hors du commun.

«J'ai trop la flemme». C'était la phrase préférée de Nagi Seishirô, quand il menait une vie ennuyeuse et monotone… Seulement, tout a changé quand il a croisé le chemin de Reo Mikage, un élève de son école qui rêve de remporter la Coupe du monde de football. C'est ce dernier qui découvre le talent caché de Nagi et qui le pousse à jouer au football pour montrer au monde entier l'étendue de son génie.